來自美國加州梅奧診所的研究人員發(fā)現(xiàn)體內(nèi)遺傳編碼序列中某個(gè)特殊位點(diǎn)攜帶了一個(gè)“G”，而不是“A”的人群，比正常人群患有某種類型腦癌的幾率，高出大約6倍。
這項(xiàng)研究是由遺傳學(xué)家Margaret Wrensch，John Wiencke教授等人完成，公布在2013年8月12日Nature Genetics雜志上，這將能幫助研究人員確定某種亞型神經(jīng)膠質(zhì)瘤的患病風(fēng)險(xiǎn)，這種疾病每年在美國診斷出的23000例腦癌癥病例中占據(jù)約4600人。
基于這個(gè)發(fā)現(xiàn)，科學(xué)家們已經(jīng)開始考慮進(jìn)行有關(guān)臨床測試，只通過血液檢查，就能告訴腦掃描異常的患者，他們患有什么樣的腫瘤
研究人員還需要了解這種特殊的DNA變化是如何引發(fā)腫瘤的，Wrensch說，因?yàn)?ldquo;這是發(fā)現(xiàn)的*例，DNA非編碼區(qū)域的改變與患癌風(fēng)險(xiǎn)緊密關(guān)聯(lián)。”
幾年前，當(dāng)研究人員開始捕捉可能與膠質(zhì)瘤發(fā)展相關(guān)聯(lián)的基因組區(qū)域的時(shí)候，他們發(fā)現(xiàn)8號染色體中具有單核苷酸多態(tài)性SNPs的一個(gè)區(qū)域，與腦癌相關(guān)，之后Wrensch等人利用的基因組技術(shù)，搜尋導(dǎo)致腦癌形成的SNP。
他們發(fā)現(xiàn)了七個(gè)候選基因，其中有一個(gè)稱為rs55705857，這個(gè)基因之于膠質(zhì)瘤，正如BRCA1之于乳腺癌。
有趣的是， 這一地區(qū)僅通過zui費(fèi)力的方法：新一代測序方法才能被發(fā)現(xiàn)，這說明實(shí)驗(yàn)和數(shù)學(xué)的快捷方式可能會錯(cuò)過這樣罕見的，高潛力的基因突變，作者說。
Wrensch等人發(fā)現(xiàn)帶有一種SNP——“G”，或者稱鳥嘌呤的患者神經(jīng)膠質(zhì)瘤發(fā)展緩慢，而帶有更常見的“A”腺嘌呤多態(tài)性的患者則相反。
“了解這種變異如何使患者腫瘤發(fā)展緩慢（還是致命的），非常重要”，Wrensch說。“這zui終也許能發(fā)現(xiàn)扭轉(zhuǎn)這些腫瘤的進(jìn)程，或阻止腫瘤形成的方法。”
除此之外，研究人員還比較了這一基因變異在哺乳動(dòng)物進(jìn)化中的整個(gè)序列，發(fā)現(xiàn) 這一基因很保守，zui早可以追溯到鴨嘴獸。研究人員還通過計(jì)算機(jī)建模，指出該區(qū)域也許編碼一段小分子RNA，一種能調(diào)控細(xì)胞內(nèi)遺傳信息活性的核苷酸。
這一模型發(fā)現(xiàn)SNP位于小分子RNA的功能區(qū)域，這表明從“A”到“G”的遺傳變化帶來了嚴(yán)重后果。該研究小組正在分析這種小分子RNA確實(shí)存在，其功能可能是什么。
“變化后的小分子RNA可能靶向抑癌基因，可能激致癌基因，也有可能會參與調(diào)節(jié)基因組的穩(wěn)定性，或者是這些都有，” John Wiencke說。 “現(xiàn)今基因組時(shí)代的zui大挑戰(zhàn)之一，就是找到所有這些新的基因突變的功能。”
（·Science：基因組測序解密癌癥醫(yī)學(xué)之謎（8-27）·Cell子刊：癌癥研究生力軍（8-23）·Science重要發(fā)現(xiàn)：癌癥與微生物組（8-20）·Nature挑戰(zhàn)癌癥經(jīng)典觀點(diǎn)：缺失基因讓癌癥罷工（8-16）·李文雄院士Nature子刊發(fā)表癌癥新研究論文（8-16）原文摘要：
A low-frequency variant at 8q24.21 is strongly associated with risk of oligodendroglial tumors and astrocytomas with IDH1 or IDH2 mutation Variants at 8q24.21 have been shown to be associated with glioma development. By means of tag SNP genotyping and imputation, pooled next-generation sequencing using long-range PCR and subsequent validation SNP genotyping, we identified seven low-frequency SNPs at 8q24.21 that were strongly associated with glioma risk （P = 1 × 10−25 to 1 × 10−14）. The most strongly associated SNP, rs55705857, remained highly significant after individual adjustment for the other top six SNPs and two previously published SNPs. After stratifying by histological and tumor genetic subtype, the most significant associations of rs55705857 were with oligodendroglial tumors and gliomas with mutant IDH1 or IDH2 （odds ratio （OR） = 5.1, P = 1.1 × 10−31 and OR = 4.8, P = 6.6 × 10−22, respectively）. Strong associations were observed for astrocytomas with mutated IDH1 or IDH2 （grades 2–4） （OR = 5.16–6.66, P = 4.7 × 10−12 to 2.2 × 10−8） but not for astrocytomas with wild-type IDH1 and IDH2 （smallest P = 0.26）. The conserved sequence block that includes rs55705857 is consistently modeled as a microRNA
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